L'Association Africaine de l'eau s’est vue confier par l’AMCOW le Conseil des Ministres africains de l'Eau l’organisation des Jeunes Professionnels africains de l’Eau et de l'Assainissement dans le cadre de la mise en en œuvre de sa stratégie et politique d'intégration de la jeunesse dans les activités du secteur de l'eau et de l'assainissement en Afrique. Ce programme encourage la formation des comités nationaux et suit leurs activités pour s’assurer qu'ils sont actifs et productifs. L’AAE, en partenariat avec USAID/FABRI, a aussi mis en place un programme de petites subventions d’un montant global de US $ 300.000 au profit des Jeunes Professionnels Africains de l’Eau et de l’Assainissement en vue de leur permettre de contribuer eux au développement de solutions pour réduire l’Eau Non Facturée et améliorer les services de l’assainissement en milieu urbain en Afrique.